莫西沙星、环丙沙星、左氧氟沙星都属于常用的氟喹诺酮类抗菌药物，但三者在抗菌谱、适应证等方面存在区别，临床需要根据其不同特点合理选用。
1是否“呼吸喹诺酮”莫西沙星、左氧氟沙星对社区获得呼吸道感染的常见病原菌，如肺炎链球菌、化脓性链球菌、流感嗜血杆菌和卡他莫拉菌，及肺炎支原体、肺炎衣原体、嗜肺军团菌等的抗菌活性较强。因此，又被称为“呼吸喹诺酮类”。而环丙沙星对肠杆菌科细菌、铜绿假单胞菌等G-菌具良好抗菌作用，而对肺炎链球菌等G+菌作用较弱。因此，环丙沙星不属于“呼吸喹诺酮”。
2 抗菌谱不同
莫西沙星抗菌谱较广，能够覆盖常见的G+球菌及G-杆菌，并且还能覆盖厌氧菌（左氧氟沙星和环丙沙星对厌氧菌作用较差），莫西沙星在抗菌谱上较其他2个抗菌药物对G+球菌作用较强，但对G-杆菌中的铜绿假单胞菌无治疗价值。
环丙沙星对肠杆菌科细菌、铜绿假单胞菌等G-菌具良好抗菌作用，其中对铜绿假单胞菌是氟喹诺酮类中作用最强的，但对G+球菌作用较差，对厌氧菌无作用。
左氧氟沙星抗菌谱是集成了莫西沙星和环丙沙星的优点，对G+球菌和G-杆菌都有较好的作用，保留了环丙沙星对铜绿假单胞菌的抗菌活性，也保留了莫西沙星对G+球菌的较好的作用，临床应用最为广泛。
适应证不同由于莫西沙星在尿中分布较少，说明书适应证无治疗泌尿系感染，而其它2个抗菌药物均可。
给药频率不同氟喹诺酮类抗菌药物属于浓度依赖性，一般一日一次给药即可。如莫西沙星和左氧氟沙星，但环丙沙星由于半衰期较短，通常需要一日2-3次给药。
不良反应不同莫西沙星、环丙沙星、左氧氟沙星在不良反应发生率略有不同。比如莫西沙星较少引起光敏反应，对血糖无显著影响。对于骨骼肌肉系统损伤，左氧氟沙星较其它2个药发生率高。
药物间相互作用
在和氨茶碱联合应用时，环丙沙星明显升高茶碱血药浓度，而左氧氟沙星和莫西沙星影响较小。
